生物信息学理论与实践CSC8313

课程内容：

本课程旨在让学生了解生物信息学分析背后的基本理论、现代生物信息学的计算和算法方法，以及实际应用这些理论的经验。课程介绍了分子生物学、序列分析和基因组时代生物学的基本概念。同时，介绍了许多不同的工具及其用法，以及其中一些工具背后的分析算法，包括 BLAST 和动态编程。此外，还介绍了生物序列分析、组装、比较和注释的高级方法，包括比较基因组学。除此之外，课程还介绍了蛋白质主题、结构和家族以及系统发生学的基础知识。课程的后半部分将介绍现代后基因组生物信息学背后的概念，包括生物通路和网络材料。

课程目标：

1、介绍分子生物学研究中产生的数据。

2、强化序列分析和后基因组生物信息学概念和技术的基础理论。

3、了解生物信息学分析的分布式可用资源。

课程大纲：

1、分子生物学的基本概念：基因组、转录组、蛋白质组。

2、数据库搜索工具。

3、测序算法。

4、序列分析：基因组组装和注释、序列比对和比较、多序列比对。

5、系统发育分析、基因组比较和分子进化。

6、蛋白质家族。

7、蛋白质结构预测。

8、生物网络分析，包括基因网络和通路分析。

9、转录组学和蛋白质组学分析，包括单细胞数据分析。

10、其他组学数据分析。